Siempre es un lío y ya si al final lo tienes que llevar a Flex mas todavía. Pero esta parece una forma muy buena de pasar fechas de MySQL a PHP
De MySQL a PHP:
$fechaPHP=strtotime($fechaMySQL);
Esto nos guarda la fecha para que ya la podamos usar de forma natural en PHP en formato Date;
De PHP a MySQL:
$fechaMySQL=date( […]